Nieuwe meettechnieken helpen waterbeheerders sneller en gerichter te reageren op actuele gezondheidsrisico’s voor waterrecreanten. Het TKI-project “Snelle detectie van fecale verontreiniging in zwemwater” beoordeelt welke rol de mobiele qPCR kan vervullen om waterbeheerders hierin te ondersteunen. Deze moleculaire analysemethode qPCR maakt het mogelijk om al in een vroeg stadium de aanwezigheid van ziekteverwekkende micro-organismen (of indicatoren daarvan) te meten.

Zoektocht nar betrouwbare apparatuur

In 2017 en 2018 heeft AQUON samen met Deltares, diverse waterschappen en laboratoria testen uitgevoerd met een mobiel qPCR-systeem. Met dit systeem zijn E.coli-analyses langs de waterkant uitgevoerd en waren de resultaten binnen 1,5 uur beschikbaar. Tijdens deze pilotexperimenten kwam naar voren dat het uitvoeren van de qPCR goed verloopt. Maar het vaststellen van de absolute E.coli waarden bleek nog te onbetrouwbaar. Het apparaat dat gebruikt is bij de pilot voldeed niet aan de wensen. In de zoektocht naar een beter apparaat kruisten de wegen van Deltares en Orvion zich. Orvion heeft zelf een betrouwbare veldkit voor DNA-isolatie ontwikkeld: de Mobilab. Daarbij is het van belang dat de workflow kan worden uitgevoerd door niet-specialisten en dat er geen ‘cold chain’ (koeling van monsters/reagentia) en randapparatuur nodig is. De betrouwbaarheid van de DNA-isolatie in het veld is sterk verbeterd. Ook de manier van monstername is verbeterd waardoor het mogelijk is om grotere volumes monster te kunnen filtreren. Deltares is enthousiast en ervan overtuigd dat dit ook voor de waterbeheerders in Nederland interessant is.

Nieuw pilot-experiment

In een nieuw pilotexperiment kunnen we demonstreren of de nieuwe veldmethode voor DNA-isolatie geschikt is voor Nederlands oppervlaktewater. 

Afb.1.Proefopzet 

AQUON neemt actief deel aan deze nieuwe pilot. Sander van Eijk zorgt voor de monstername en de analyse in het veld.

  

Afb.2.Monstername en Afb.3.Filtratie

  

Afb.4. Voorbereiding isolatie en Afb.5.DNA isolatie

In het laboratorium van AQUON wordt de hoeveelheid aan E.coli met de MPN-methode vastgesteld. De lab qPCR-methode zal worden uitgevoerd door Deltares. AQUON zal de monsters ook bepalen met qPCR zodat de verkregen resultaten vergeleken kunnen worden met de resultaten van Deltares. Op deze manier kunnen we controleren of we op de goede weg zijn.

Samenwerkingspartners

Samenwerkingspartners binnen het TKI-project: Aqualab Zuid, Aqualysis, AQUON, Deltares, Gemeente Breda, Hoogheemraadschap van Delfland, Hoogheemraadschap de Stichtse Rijnlanden, Hoogheemraadschap van Rijnland, KWR, MicroLAN, Orvion, Partners4UrbanWater, Rijkswaterstaat, Sopachem, STOWA, Waternet, Waterproef, Waterschap Brabantse Delta en Waterschap de Dommel.

Ook interessant

De toekomst van DNA-analyses met PCR 21 januari 2021

Interessant artikel in BioNieuws over PCR en qPCR

Lees meer
NEN Publicatie whitepaper 'Plastics in het Milieu' 28 december 2020

Aftrap van het Nederlandse normalisatietraject voor plastics in het milieu

Lees meer
Fijne feestdagen en een goede en gezonde start van 2021 22 december 2020

2020 loopt ten einde. Wat een jaar!

Lees meer
Controle en validatie nitraat-sensoren 15 december 2020

Samen met microLAN op pad om de nitraat-sensoren te controleren en valideren.

Lees meer
AQUON blijft voorloper bij blauwalg risico zwemwateranalyses 14 december 2020

ELISA in te zetten voor het meten van virussen, bacteriën en toxinen

Lees meer
Sensormeting in Breda geslaagd van opzet 14 december 2020

Data en resultaten geven een duidelijk beeld van de waterkwaliteit

Lees meer