Als afstudeeropdracht heeft onze nieuwe medewerker Sander Heeman onderzoek gedaan naar de vraag of we een relatie kunnen ontdekken tussen de huidige technieken om cyanobacteriën en hun verschillende toxigenen te kwantificeren. De afgelopen maanden heeft Sander veel tijd besteed aan het ontwikkelen van primers, probes, interne controles en een optimale qPCR-methode voor het kwantificeren van cyanobacteriën en hun verschillende toxine genen. Voor het ontwikkelen is gebruik gemaakt van reeds eerder gepubliceerd onderzoek. De gevonden sequenties zijn door Sander getoetst op specificiteit, waarna de methode geoptimaliseerd kon worden.

Inmiddels zijn de methoden voor het kwantificeren van cyanobacteriën en het toxine gen microcystine zover dat we de eerste monsters kunnen meten en vergelijken met de biovolumetelling van de blauwalgen. Uit de eerste resultaten valt voorzichtig op te maken er dat tussen de biovolumetelling en de kwantificatie van cyanobacteriën rondom qPCR een correlatie aanwezig is. Bij de ontwikkeling van de primers en probes is gebleken dat mogelijk ook groenalgen worden meebepaald. Om een goed antwoord te krijgen op de vraag, zullen nog meer monsters onderzocht moeten worden met wisselende samenstellingen.

Grafieken 1, 2 en 3: Resultaten blauwalgenvergelijkingsonderzoek

Voor wat betreft de vraag of de aanwezige cyanobacteriën ook zorgen voor toxines in het water, valt uit de resultaten tot nu toe op te maken dat het zeker niet zo is dat de aanwezigheid van bepaalde potentieel toxine producerende cyanobacteriën ook leidt tot de aanwezigheid van de bijbehorende toxine genen.

Ook interessant

De toekomst van DNA-analyses met PCR 21 januari 2021

Interessant artikel in BioNieuws over PCR en qPCR

Lees meer
NEN Publicatie whitepaper 'Plastics in het Milieu' 28 december 2020

Aftrap van het Nederlandse normalisatietraject voor plastics in het milieu

Lees meer
Fijne feestdagen en een goede en gezonde start van 2021 22 december 2020

2020 loopt ten einde. Wat een jaar!

Lees meer
Controle en validatie nitraat-sensoren 15 december 2020

Samen met microLAN op pad om de nitraat-sensoren te controleren en valideren.

Lees meer
AQUON blijft voorloper bij blauwalg risico zwemwateranalyses 14 december 2020

ELISA in te zetten voor het meten van virussen, bacteriën en toxinen

Lees meer
Sensormeting in Breda geslaagd van opzet 14 december 2020

Data en resultaten geven een duidelijk beeld van de waterkwaliteit

Lees meer